Образован 16 апреля 1932 года
Объект Всемирного природного наследия ЮНЕСКО (с 1998 года)
Включён во Всемирную сеть биосферных резерватов Программы ЮНЕСКО «Человек и биосфера» (МАБ) - 26 мая 2009 года
Входит в список «Global-200» - девственных или мало изменённых экорегионов мира, в которых сосредоточено 90% биоразнообразия планеты
Коллектив Алтайского заповедника выражает искренние соболезнования родным, близким и коллегам погибших при проведении в Кош-Агачском районе работ сотрудников комитета по охране, использованию и воспроизводству объектов животного мира Республики Алтай Юрия Валентиновича Михайлова и Ырыспая Токтошева.
Юрий Валентинович Михайлов работал заместителем председателя комитета по охране, использованию и воспроизводству объектов животного мира Республики Алтай с ноября 2014 года. Ырыспай Токтошев был одним из участников первого полномасштабного учета численности сибирского горного козла в качестве экспедитора и гида-проводника, входил в состав общественной бригады, созданной по инициативе местных жителей и Всемирного фонда дикой природы (WWF) и принимал участие в патрулировании особо охраняемых природных территорий на территории Кош-Агачского района Республики Алтай.